Alitalia Express được thành lập năm 1997, từ hãng "Avianova" cũ, và bắt đầu hoạt động từ ngày 1.10.1997 và là hãng phụ thuộc của Alitalia. Hãng hiện có 710 nhân viên.[1] Tháng 3/2003 có tin loan báo là hãng Alitalia sẽ mua lại hãng Minerva Airlines (ngưng hoạt động) và chuyển đội máy bay tua-bin cánh quạt của Alitalia Express cho Minerva Airlines, nhưng việc đó không thành và tháng 9/2004 Alitalia loan báo kế hoạch mua thêm 12 máy bay Embraer E-170 cho Alitalia Express.